Zakres przedmiotowy audytu zewnętrznego projektu skoncentrowany jest na dokonaniu ogólnej oceny realizacji projektu dofinansowanego z funduszy Unii Europejskiej. Kluczowymi elementami kontroli są:

1. Przegląd zrealizowanych działań oraz ich zgodność z założeniami zawartymi we wniosku o dotację oraz w umowie dotacji.

2. Przegląd realizacji wskaźników oraz ich odniesienie do założeń zawartych we wniosku o dotację.

3. Kontrola formy przechowywania dokumentów związanych z dotacją.

4. Oceny prawidłowości rozliczeń finansowych, obejmującą w szczególności:

• Weryfikację na podstawie próby oryginałów dokumentów księgowych dokumentujących wydatki poniesione w ramach projektu w tym przegląd umów, faktur, dowodów zapłaty, protokołów odbioru i innych dokumentów potwierdzających fakt zakupu określonych towarów i usług.
• Weryfikację na podstawie próby dokumentów poprawność zachowania procedur wyboru oferentów w tym przegląd zapytań ofertowych, wydruków z ogłoszenia, ofert, protokoły wyboru wykonawcy.
• Sprawdzenie, czy prowadzona jest wyodrębniona ewidencja wydatków dla projektu zgodnie z zasadami określonymi dla właściwego programu operacyjnego.
• Sprawdzenie, czy wkład własny jest wniesiony zgodnie z harmonogramem projektu i jeśli to możliwe, ujęty w wyodrębnionej ewidencji wydatków projektu.
• Sprawdzenie, czy z dokumentów nie wynika, że w ramach projektu nie finansuje się zwykłej działalności jednostki realizującej projekt, a jedynie koszty związane z realizacją projektu.
• Sprawdzenie, czy z dokumentów nie wynika, że koszty ponoszone w ramach projektu są podwójnie finansowane.
• Sprawdzenie statusu podatkowego beneficjenta w zakresie podatku VAT oraz czy forma rozliczania podatku VAT jest zgodna z deklarowanym statusem podatkowym.

W ramach audytu powstaje raport sprawozdawczy, z którego wynika zakres skontrolowanych dokumentów, zauważone nieprawidłowości oraz sugerowane zgodne z prawem sposoby ich usunięcia.